Разработка и применение мультиплексной ПЦР для идентификации трёх видов грибов рода Parastagonospora, распространенных в России
Ключевые слова:
молекулярная диагностика, пшеница, септориоз, Parastagonospora nodorum, Parastagonospora pseudonodorum, Parastagonospora avenaeАннотация
Разработана и валидирована мультиплексная ПЦР-система для специфической диагностики трех патогенов злаковых культур рода Parastagonospora, распространенных на территории России: P. nodorum, P. avenae и P. pseudonodorum. В качестве мишени выбран участок гена YPEL (Yippee-like protein), обладающий достаточным уровнем межвидового полиморфизма для конструирования высокоспецифичных праймеров. Специфичность праймеров подтверждена in silico, а также in vitro на коллекции референсных изолятов. Разработанные праймеры эффективно работают в мультиплексном формате, обеспечивая селективную детекцию каждого вида. Продемонстрирована высокая чувствительность системы — уверенная детекция достигается при концентрации геномной ДНК в реакционной смеси от 1 пг. Данный набор может быть использован для фитосанитарного мониторинга и исследований в области эпидемиологии септориозов злаковых культур.
